Вы сами то читали то на что ссылку скинули?
В смете налог при УСН называется : Возврат затрат при упрощенной системе налогообложения- это раз и считается она по формуле, а не коэф.- это два. Какой возврат НДС?
У Вас что в контракте написано? в заключенном уже. Если контракт с НДС, значит и смета должна быть с НДС, как Вы потом с налоговиками будете разбираться, это не головная боль Заказчика, а Ваша. Вы Заказчику нормальные документы сдайте, а сами топом разбирайтесь, почему при заключении контракта допустили оплошность и на УСН заключились с НДС.
Это где это, стесняюсь спросить, практикуется, когда контракт с НДС а смета с формулой УСН?
У нас с Вами диалог слепого с глухим, извиняюсь, не в обиду.

Составление смет, КС-2, КС-3, Проверка достоверности сметной стоимости и применения расценок, Экспертиза смет. Все регионы РФ.