Протокол разногласий к контракту оформлять, куда проставить Цену контракта такую, как размещена на сайте в Извещении.
В Реестр контрактов на сайте разносить уже доработанный контракт с учетом протокола разногласий, все разносить с контракта, но чтобы в контракте цена была одинакова с ценой, указанной в Извещении.
Интересно, а что они напишут в протоколе разногласий: " мы не согласны, так как мы от балды сами тарифы выдумали, а Вы нам тут свои подсовываете"; и основание в протоколе разногласий: вместо ссылки на закон-наши хотелки.