Принцип: доказать отсутствие чего-либо невозможно. В принципе!
Именно поэтому не заказчику предлагается искать УЗа в реестре СМП, а УЗу предоставлять выписку. И именно УЗ должен озаботиться своим присутствием в реестре. А зак волен ему поверить или проверить подлинность представленной выписки.
Закон определяет только один случай, когда УЗ может не иметь выписки и поэтому волен представить декларацию - УЗ "юный". Его "юность" легко смотрится по ЕГРЮЛ. И далее зак с полным правом может отклонять "старого" УЗа за отсутствие выписки. А "юному" может либо верить на слово, либо запрашивать налоговую.
Система такая. А все вероятные технические отклонения от неё решаются заком на своё усмотрение. И на свой страх и риск. Хотя не вижу тут никакого особенного риска, кроме отмены протокола.